Yozgat doğumlu olan Kaymakamımız, ilköğrenimi Yozgat ili Çekerek ilçesinde, ortaöğrenimini Ankara’da tamamlamıştır. Uludağ Üniversitesi İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi Maliye Bölümünden 2013 yılında mezun olmuştur. Mesleki kariyerine 2014 yılında İstanbul Vergi Dairesi Başkanlığında Gelir Uzman Yardımcısı olarak başlayan Kaymakam Cafer Ekinci ilgili kurumda uzmanlığını almıştır. 2018 yılında Kaymakam Adaylığı sınavında başarı sağlayarak 107. Dönem Yalova Kaymakam Adayı olarak Mülki İdare Mesleğine intisap etmiştir. İl merkez stajını Yalova Valiliğinde, refiklik stajlarını sırasıyla Kayseri/Develi ve Çanakkale/Eceabat ilçelerinde meslek büyüklerinin refakatinde tamamlamıştır. Kırklareli/Demirköy ve Niğde/Çamardı ilçelerinde vekalet görevinde bulunmuştur.
Enez ilçesine atanan Ekinci, evli ve bir çocuk babasıdır.